Une des différences avec la vaginoplastie simple est la profondeur, avec une colovaginoplastie nous pouvons atteindre 20 cm ou plus. Habituellement, nous laissons un segment du gros intestin qui va de l'introitus vaginal à la partie supérieure du promontoire sacré, c'est-à-dire à la cavité abdominale, d'où les rapports sexuels deviennent tout à fait normaux. Une autre différence est que la muqueuse du côlon sécrète du mucus, donc elle lubrifie très bien le néovagin. La raison pour laquelle cette technique n'est pas pratiquée chez tous les patients est qu'il s'agit d'une chirurgie plus longue avec un temps de récupération plus long. De plus, une connexion chirurgicale dans le gros intestin a des temps de cicatrisation et peut présenter des risques mortels en cas de fuite anastomotique. Il peut y avoir une infection intra-abdominale ou une nécrose de la greffe intestinale que nous avons interposée entre la prostate et le rectum. Il s'agit donc d'une chirurgie plus délicate et avec un peu plus de risques, elle est donc réservée aux personnes qui veulent aller plus en profondeur et qui acceptent les risques.
Il est nécessaire de faire une évaluation préalable pour pouvoir conseiller à chaque patient quelle est la meilleure technique pour lui, donc vous devez toujours parler de vos habitudes sexuelles, si vous voulez beaucoup de profondeur et quel partenaire vous avez. Il y a des personnes qui ne veulent pas avoir de relations sexuelles et la profondeur n'a pas trop d'importance, seulement l'apparence, des personnes qui sont homosexuelles dans leur transsexualité, donc elles n'auront jamais de relations avec un homme, des personnes qui sont plus âgées et plus à risque et qui ne veulent pas les assumer.